Skip to main content

Table 4 Standard deviation of the mean for the imputed variables, average of 500 samples of n = 400, k = 5, 15 % or 30 % of missing data

From: Nearest neighbor imputation algorithms: a critical evaluation

  

X0

X1

X 2

 

Missing

15 %

30 %

15 %

30 %

15 %

30 %

Framework

Method

Bias

Var

MSE

Bias

Var

MSE

Bias

Var

MSE

Bias

Var

MSE

Bias

Var

MSE

Bias

Var

MSE

Plain

1NN

0.5074

2.3775

2.6302

1.0086

3.5607

4.5708

0.0232

0.0279

0.0284

0.043

0.0423

0.0441

-0.0022

0.1952

0.1948

0.0487

0.3396

0.3413

 

kNN

2.455

1.9712

7.9943

5.1169

2.2592

28.4371

0.2575

0.0222

0.0884

0.523

0.0238

0.2972

0.5701

0.1469

0.4716

1.2426

0.1643

1.708

 

wkNN

2.4528

1.9704

7.9826

5.1114

2.2626

28.3844

0.2573

0.0222

0.0883

0.5225

0.0238

0.2967

0.5698

0.1469

0.4713

1.2412

0.1646

1.7049

RReliefF10

1NN

0.4393

2.4004

2.5885

0.761

3.3207

3.8931

0.0219

0.0276

0.0281

0.0316

0.0366

0.0375

0.015

0.1709

0.1707

0.0996

0.2514

0.2608

 

kNN

2.0991

2.0623

6.4642

4.5112

2.533

22.8788

0.2506

0.0228

0.0856

0.5098

0.0249

0.2848

0.5737

0.1449

0.4738

1.2486

0.1575

1.7162

 

wkNN

2.0946

2.0633

6.4464

4.4987

2.5357

22.7687

0.2504

0.0228

0.0855

0.5091

0.025

0.2841

0.5735

0.1448

0.4734

1.2476

0.1577

1.7138

RReliefF20

1NN

0.5633

2.2892

2.6019

0.994

3.2527

4.2343

0.0321

0.0261

0.0271

0.0511

0.0354

0.0379

0.0279

0.1786

0.179

0.1011

0.2649

0.2746

 

kNN

2.2315

2.0225

6.998

4.72

2.3146

24.5886

0.2541

0.0222

0.0867

0.515

0.0246

0.2898

0.576

0.1437

0.4752

1.2559

0.1563

1.7334

 

wkNN

2.2275

2.0219

6.9796

4.7088

2.3178

24.4859

0.2539

0.0222

0.0866

0.5143

0.0246

0.2891

0.5757

0.1437

0.4748

1.2545

0.1564

1.7297

RReliefF30

1NN

0.6213

2.3558

2.7371

1.0826

3.417

4.5821

0.0321

0.0252

0.0262

0.0606

0.0367

0.0402

0.029

0.1781

0.1786

0.1471

0.2647

0.2858

 

kNN

2.2891

2.0022

7.2382

4.8352

2.3793

25.7541

0.2557

0.0224

0.0878

0.5193

0.024

0.2936

0.578

0.1455

0.4793

1.2588

0.155

1.7392

 

wkNN

2.2863

2.0032

7.2263

4.8256

2.3794

25.6606

0.2555

0.0224

0.0876

0.5186

0.024

0.2929

0.5776

0.1454

0.4787

1.2574

0.1551

1.7358

Bagging

1NN

2.8371

1.926

9.9715

5.9696

2.0865

37.7185

0.2994

0.0219

0.1115

0.6124

0.0226

0.3976

0.6678

0.1438

0.5895

1.4532

0.1515

2.2629

 

kNN

3.0206

1.9076

11.0279

6.363

2.0181

42.5012

0.3164

0.0218

0.1219

0.6478

0.0222

0.4418

0.706

0.1432

0.6413

1.5354

0.1473

2.5044

 

wkNN

3.0141

1.9084

10.9892

6.342

2.0229

42.2391

0.316

0.0218

0.1216

0.6464

0.0222

0.44

0.7051

0.1432

0.6401

1.5322

0.1476

2.4949

Random

1NN

2.9856

1.9079

10.8177

6.2409

2.0297

40.9738

0.3132

0.0218

0.1199

0.6386

0.0222

0.4299

0.6984

0.1425

0.63

1.516

0.1472

2.4451

 

kNN

3.0477

1.9032

11.188

6.3797

2.0142

42.7108

0.3193

0.0218

0.1237

0.652

0.0222

0.4472

0.7123

0.1426

0.6497

1.5472

0.1466

2.5401

 

wkNN

3.0473

1.9032

11.1854

6.3787

2.0143

42.6979

0.3193

0.0218

0.1237

0.6519

0.0222

0.4472

0.7123

0.1426

0.6496

1.5471

0.1466

2.5397

Bagging + Random

1NN

3.0144

1.9068

10.9895

6.3079

2.0163

41.8015

0.3149

0.0218

0.121

0.6423

0.0222

0.4347

0.7015

0.1427

0.6345

1.5238

0.1474

2.469

 

kNN

3.0742

1.9011

11.3478

6.4416

2.0055

43.4956

0.3205

0.0218

0.1245

0.6548

0.0222

0.4509

0.7141

0.1426

0.6523

1.552

0.1466

2.5549

 

wkNN

3.0733

1.9012

11.3424

6.4393

2.0056

43.4661

0.3205

0.0218

0.1245

0.6547

0.0222

0.4508

0.7141

0.1426

0.6522

1.5518

0.1466

2.5542

Mean Imputation

 

3.1024

1.8985

11.5198

6.5012

1.9981

44.2595

0.3224

0.0218

0.1257

0.659

0.0222

0.4564

0.7181

0.1425

0.6578

1.5606

0.1465

2.5817

Back to article page

BMC Medical Informatics and Decision Making

ISSN: 1472-6947

Contact us