Nearest neighbor imputation algorithms: a critical evaluation

Beretta, Lorenzo; Santaniello, Alessandro

doi:10.1186/s12911-016-0318-z

BMC Medical Informatics and Decision Making

Table 1 Regression Coefficients, average of 500 samples of n = 400, k = 5, 15 % or 30 % of missing data

From: Nearest neighbor imputation algorithms: a critical evaluation

		β₀						β₁						β₂
	Missing	15 %			30 %			15 %			30 %			15 %			30 %
Framework	Method	Bias	Var	MSE	Bias	Var	MSE	Bias	Var	MSE	Bias	Var	MSE	Bias	Var	MSE	Bias	Var	MSE
Plain	1NN	0.1899	0.0012	0.0373	0.3277	0.0014	0.1088	0.1915	0.0265	0.0631	0.3496	0.0464	0.1685	-0.1065	0.0058	0.0171	-0.2156	0.0084	0.0549
	kNN	0.0927	0.0005	0.0091	0.1817	0.0009	0.0339	0.045	0.0181	0.0201	0.0638	0.0425	0.0465	-0.0225	0.0039	0.0044	-0.0589	0.0076	0.011
	wkNN	0.0925	0.0005	0.0091	0.1811	0.0009	0.0337	0.0451	0.0181	0.0201	0.0639	0.0425	0.0465	-0.0227	0.0039	0.0044	-0.0594	0.0076	0.0111
RReliefF10	1NN	0.158	0.0017	0.0267	0.3025	0.003	0.0944	0.1901	0.0252	0.0613	0.3672	0.0415	0.1763	-0.1003	0.0046	0.0146	-0.2083	0.0082	0.0516
	kNN	0.0737	0.001	0.0064	0.1587	0.0025	0.0277	0.0462	0.0176	0.0197	0.0824	0.0384	0.0451	-0.0227	0.0038	0.0043	-0.0602	0.0073	0.0109
	wkNN	0.0734	0.001	0.0064	0.1584	0.0025	0.0276	0.0463	0.0175	0.0196	0.0827	0.0384	0.0452	-0.0228	0.0037	0.0042	-0.0602	0.0073	0.0109
RReliefF20	1NN	0.1604	0.0012	0.0269	0.298	0.0023	0.0911	0.1803	0.0241	0.0566	0.3594	0.0443	0.1734	-0.0976	0.0047	0.0142	-0.2097	0.0073	0.0513
	kNN	0.0715	0.0007	0.0058	0.153	0.0017	0.0251	0.0407	0.0174	0.019	0.0701	0.0399	0.0447	-0.0208	0.0036	0.0041	-0.0607	0.0072	0.0108
	wkNN	0.0712	0.0007	0.0057	0.1524	0.0017	0.0249	0.0408	0.0173	0.0189	0.0707	0.0399	0.0448	-0.0209	0.0036	0.0041	-0.0609	0.0071	0.0108
RReliefF30	1NN	0.1617	0.0012	0.0274	0.2982	0.0018	0.0908	0.183	0.0221	0.0555	0.3468	0.0438	0.164	-0.0986	0.0049	0.0147	-0.2005	0.0081	0.0483
	kNN	0.073	0.0006	0.0059	0.1533	0.0013	0.0248	0.0383	0.0155	0.017	0.0633	0.0387	0.0426	-0.0201	0.0036	0.004	-0.0565	0.0068	0.01
	wkNN	0.0727	0.0006	0.0058	0.1527	0.0013	0.0246	0.0384	0.0155	0.017	0.064	0.0388	0.0428	-0.0202	0.0036	0.004	-0.0565	0.0068	0.01
Bagging	1NN	0.0812	0.0004	0.007	0.1593	0.0008	0.0262	0.0182	0.0176	0.0179	0.002	0.0394	0.0393	-0.007	0.0038	0.0039	-0.0244	0.0073	0.0079
	kNN	0.0869	0.0004	0.008	0.168	0.0008	0.029	0.0095	0.0176	0.0176	-0.015	0.0394	0.0395	-0.0006	0.0039	0.0039	-0.0098	0.0074	0.0075
	wkNN	0.0857	0.0004	0.0078	0.1651	0.0008	0.028	0.0096	0.0175	0.0176	-0.0153	0.0392	0.0394	-0.0008	0.0039	0.0039	-0.0104	0.0073	0.0074
Random	1NN	0.0874	0.0004	0.0081	0.1589	0.0007	0.0259	0.0121	0.018	0.0181	-0.0114	0.0387	0.0388	-0.0003	0.0041	0.0041	-0.0122	0.0074	0.0076
	kNN	0.0872	0.0004	0.008	0.1572	0.0007	0.0254	0.0081	0.0177	0.0177	-0.0212	0.0385	0.0389	0.0014	0.004	0.004	-0.007	0.0074	0.0074
	wkNN	0.0872	0.0004	0.008	0.1571	0.0007	0.0253	0.0081	0.0177	0.0177	-0.0212	0.0385	0.0389	0.0014	0.004	0.004	-0.007	0.0074	0.0074
Bagging + Random	1NN	0.0939	0.0005	0.0093	0.1686	0.0007	0.0291	0.0128	0.0187	0.0188	-0.0109	0.0388	0.0388	-0.0004	0.0041	0.0041	-0.0101	0.0074	0.0075
	kNN	0.0956	0.0005	0.0096	0.1715	0.0007	0.0301	0.0103	0.0185	0.0186	-0.0178	0.0393	0.0395	0.001	0.0041	0.0041	-0.006	0.0075	0.0075
	wkNN	0.0953	0.0005	0.0095	0.1708	0.0007	0.0299	0.0102	0.0185	0.0185	-0.0179	0.0392	0.0394	0.0011	0.0041	0.0041	-0.006	0.0075	0.0075
Mean Imputation		0.109	0.0005	0.0124	0.1913	0.0008	0.0373	0.0108	0.0196	0.0197	-0.0147	0.0407	0.0409	0.0015	0.0044	0.0043	-0.0047	0.0078	0.0078

Back to article page

ISSN: 1472-6947

Contact us

General enquiries: journalsubmissions@springernature.com