Efficient protein structure search using indexing methods

Table 1 Top-2 query processing

step	output	top	updated Q (new items in bold)
0			C_5,4, C_2,3, C_3,2, C_1,3, C_4,4
1		C _5,4	$P 5, 4 (3)$ , C_5,3, C_2,3, $P 5, 4 (2)$ , $P 5, 4 (1)$ , C_3,2, C_1,3, C_4,4
2	$P 5, 4 (3)$	$P 5, 4 (3)$	C_5,3, C_2,3, $P 5, 4 (2)$ , $P 5, 4 (1)$ , C_3,2, C_1,3, C_4,4
3	$P 5, 4 (3)$	C _5,3	C_2,3, $P 5, 3 (3)$ C₅,₂, $P 5, 4 (2)$ , $P 5, 3 (2)$ , $P 5, 4 (1)$ , $P 5, 3 (1)$ , C_3,2, C_1,3, C_4,4
4	$P 5, 4 (3)$	C _2,3	$P 5, 3 (3)$ , C_5,2, $P 5, 4 (2)$ , C₂,₂, $P 5, 3 (2)$ , $P 2, 3 (3)$ , $P 5, 4 (1)$ , $P 5, 3 (1)$ , $P 2, 3 (2)$ , $P 2, 3 (1)$ , C_3,2, C_1,3, C_4,4
5	$P 5, 4 (3)$ , $P 5, 3 (3)$	$P 5, 3 (3)$	C_5,2, $P 5, 4 (2)$ , C_2,2, $P 5, 3 (2)$ , $P 2, 3 (3)$ , $P 5, 4 (1)$ , $P 5, 3 (1)$ , $P 2, 3 (2)$ , $P 2, 3 (1)$ , C_3,2, C_1,3, C_4,4

ISSN: 1472-6947